案例 06:高保真超分辨级样本-细胞微管的2D MINFLUX成像

🧪Protocol for high-fidelity Fixed 2D STORM Sample
- 细胞抽提,使用样本基底渗透液,37 ℃抽提细胞 10秒;
- 高保真微管固定,使用高保真固定液-微管37 ℃固定细胞 10min;
- 使用2ml 超纯制样PBS简短地清洗细胞 3 次;
- 压制背景荧光,使用2ml配置好的 自发荧光抑制剂,在室温下孵育样本 7min,使用侧摆摇床辅助交换液体;
- 使用2ml 超纯制样PBS简短地清洗细胞 3 次;
- 封闭抗非特异性结合位点,使用 50ul 配置好的封闭打孔液,同时使用 制样伴侣-贴壁样本辅助样本的孵育,室温下孵育细胞 30 min;
- 使用 制样伴侣-贴壁样本辅助一抗孵育,保持湿润环境,室温孵育 1小时,一抗选择 beta-tubulin E7 mouse;
- 使用 2ml 超纯制样PBS清洗一抗,5min 一次,清洗3次,使用侧摆摇床辅助交换液体;
- 抵御非特异性荧光染料结合,使用25ul 荧光净化增强液,同时使用 制样伴侣-贴壁样本辅助样本的孵育,室温孵育样本 30min;
- 使用 制样伴侣-贴壁样本辅助二抗孵育,保持湿润环境,室温孵育 1 小时,二抗选择 Alexa555 goat-anti-mouse IgG;
- 使用 2ml 超纯制样PBS清洗二抗,5min 一次,清洗3次,使用侧摆摇床辅助交换液体;
- 使用 超分辨光镊级PFA-16%,预制成 4%浓度,取 500ul 浸没样品进行后固定,时间10min。
- 在成像时,使用5ML成像缓冲液-MINFLUX,进行 2D MINFLUX成像。
⭐ 图像描述:
图像是细胞局部,单根微管的2D MINFLUX成像,位置是圆扇形的细胞边缘扁平板块伪足区域,Z 轴是细胞的最低处。微管网路稀疏,背景干净。标记密度高,采样数充足。分辨率高,可以看到清晰的微管蛋白在整个微管上的分子分布。
⭐ 标记要点:
- 培养腔壁良好、高活力且细胞体扁平的细胞。
- 微管是对温度极其敏感的细胞器。从培养箱取出到固定的全过程,必须严格避免温度波动。
- 选用适合微管的高保真固定液,防止微管解聚。
- 为使背景更干净,使用Quench试剂来抑制自发光。
- 使用比常规推荐浓度更高的一抗浓度去进行过饱和标记。
- 追求极至干净的细胞内背景,需要对细胞质进行抽提,去除细胞质中游离的 tubulin 蛋白,它们也可以被标记从而形成背景。
✨ 成像要点:
- 细胞存在异质性,精心挑选视野,选择细胞整体扁平圆形,具有板块伪足,微管网路,细胞内背景低,轴定明亮且连续的单根微管。
- 使用高活性的单分子闪烁液,保证单分子闪烁频率稳定,保护单分子不淬灭。这是获得足够采样样本的基础。MINFLUX的单分子闪烁频率要稍慢于STORM。
- 数据采集中,细胞保证收集离散的的单分子信号,以确保真实的单分子定位,减少假定位。
- 采样过程中,需要采集足够多的单分子数量,充足的采样数可以减少定位精度误差。
- 锁焦·准备:恒温在显微镜上放置十分钟,温度变化和机械形变全都趋于稳定,更利于锁焦。
🔖 标记信息:
IF
一抗:beta tubulin E7
二抗:Alexa647
🔖 成像模式:
理论定位精度~1nm
理论分辨率~2-3nm (抗体尺寸叠加)
2D MINFLUX mode
Abberior MINFLUX
—— 案例 06 · 图文实验梳理 ——